Joulukuussa 2001 Zupan kilpaili ensimmäistä kertaa kansainvälisessä kilpailussa Continental Cupilla (COC) St. Moritzissa . Vuoden Junior World Championship järjestettiin vuonna Schonach tammikuussa 2002 , hän ja joukkue voitti pronssia. Continental Cupin osana pidetyn kesän mäkihyppyjen aikana hän pystyi saavuttamaan kymmenen parhaan joukossa kansainvälisissä yksilökilpailuissa ensimmäisen kerran 21. syyskuuta 2002 Calgaryssä yhdeksännellä sijalla. Talvella 2002/03 hän kilpaili jatkuvasti Continental Cupissa ja pystyi voittamaan ensimmäisen kerran palkintokorokkeen toisella sijalla hyppyissä Braunlagessa helmikuun alussa . Kesällä 2003 hän osallistui jälleen COC: hen ja pystyi miehittämään ylin sija.
Talven 2003/04 alussa hän aloitti jälleen Continental Cupissa, mutta pääsi ensimmäistä kertaa karsintakilpailuun Liberecissä tammikuun alussa . Loput kaudella hän palasi COC, mutta osallistui Ski Flying maailmanmestaruuskilpailut 2004 vuonna Planica . Vaikka häntä ei käytetty yksilökilpailussa, hän aloitti joukkuekilpailussa ja saavutti kuudennen sijan Slovenian joukkueen kanssa. Kesän 2004 ensimmäisellä puoliskolla hän aloitti COC-hyppykilpailuissa, joissa hän juhli uransa ensimmäistä voittoa hyppyissä 9. heinäkuuta 2004 Velenjessä . Toisella puoliskolla hän aloitti Grand Prix -hypyn. Hakuban 21. sija oli hänen paras tulos.
Kaudella 2004/05 hän sai useita esiintymisiä COC: ssä ja kahdeksan esiintymistä maailmancupissa. Hän taisteli aina paikasta toisella kierroksella ja sijoittui 72. sijalle yleisarvostelussa. Hän ei osallistunut kesään 2005, talvella 2005/06 hän osallistui enimmäkseen Continental Cupiin, mutta pystyi kilpailemaan myös joissakin maailmancupissa. Tämän kauden pitäisi olla hänen paras Manner-Cupissa: hyppyissä 11. maaliskuuta Bischofshofenissa hän voisi juhlia toisen voiton ja lopulta hän sijoittui 13. sijalle yleisarviossa. Vuoden 2006 kauden päättymisen jälkeen Planicassa, jossa hän sijoittui 26. ja 25. sijalle, Zupan lopetti aktiivisen mäkihyppääjäuransa.