Helena Ekholm debytoi Östersundissa vuonna 2005 ampumahiihdon maailmanmestaruuskilpailussa (15.) . Seuraavassa Hochfilzenin maailmancupissa hän kyseenalaisti ensimmäisen yksilökilpailunsa (41.). Keväällä 2006 hän osallistui Mixed MM vuonna Pokljuka ja oli kuudes. Kun hän ei päässyt yli 16. sijasta ensimmäisellä kaudella, seuraava kausi alkoi hänelle melko menestyksekkäästi. Kolmannen kauden MM-kisoissa Hochfilzenissa hän tuli yksilössä neljänneksi ja sprintissä kahdeksanneksi. Myös kaudella hän oli neljäs Ruotsin joukkueen kanssa. Tällä Ampumahiihdon maailmanmestaruuskilpailut 2007 vuonna Antholz , hän jatkoi nousussa ja oli myös neljäs sija sprintissä. Kohokohdana hän voitti kultamitalin Ruotsin sekavälillä. Hän juhli ensimmäinen MM voitto viimeisessä kisassa 2006/07 kauden , massa aloittaa kilpailun vuonna Hanti-Mansijskissa .
Kauden 2008/09 MM-avajaisissa Helena Ekholm pääsi virheettömällä ammunnalla toisen yksilökilpailunsa ja ensimmäisen yksilökilpailussa oman yleisönsä edessä Östersundissa. Kun harjoittamisesta Ampumahiihdon maailmanmestaruuskilpailut vuonna 2009 , hän alkoi viidenneksi ja saavutti maailmanmestaruuden otsikko hyvillä kuvaamisen suorituskykyä ja hän myös voitti hopeaa sekoitettu rele ja pronssia massan alku. Sprintikilpailun jälkeen Vancouverin MM-kisoissa hän voitti maailmanmestaruuskilpailujen keltaisen pelipaidan neljännellä voitollaan kaudella. Lopulta hän kruunasi kauden voittamalla maailmanmestaruuden. Vaikka hänet oli sidottu saksalaisen Kati Wilhelmin kanssa ensimmäiseksi, maailmanmestaruuskilpailujen voitot menivät Ekholmille tämän kauden suurempien voittojen vuoksi. Ruotsalainen voitti myös Sprint ja Mass Start World Cup tällä kaudella. Vuonna 2010 Ekholm osallistui talviolympialaisiin Vancouverissa. Hänen paras tulos oli kymmenes paikka joukkolähdössä. Viestillä hän sijoittui viidenneksi. Hän aloitti raivokkaasti maailmancupissa, voittaen kaksi kauden viidestä ensimmäisestä kilpailusta kauden ensimmäisen kilpailun lisäksi, yksilönä Östersundissa. Mutta hän ei pitänyt tätä tasoa koko kauden ajan, ja lopulta hänen oli myönnettävä tappio Magdalena Neunerille ja Simone Hauswaldille ja tuli kolmanneksi. Kauden 2011/12 jälkeen Helena Ekholm lopetti uransa.
Helena Ekholm on ollut naimisissa ruotsalaisen ampumahiihtäjän David Ekholmin kanssa 17. heinäkuuta 2010 lähtien . Hänellä on kolme nuorempaa sisarusta, Jenny Jonsson , Malin Jonsson ja Mattias Jonsson, jotka kaikki harrastavat myös ampumahiihtoa.